Biogas kann in der Form, in der es aus einer Biogasanlage entnommen wird, in der Regel nicht unmittelbar einem bestimmten Verwendungszweck zugeführt werden. Es enthält Störstoffe wie Wasserdampf, Schwefelwasserstoff, Kohlendioxid und in geringem Maße auch Schmutzteilchen. Diese müssen je nach Einsatzbereich entfernt werden. Die folgende Tabelle zeigt für unterschiedliche Anwendungen den Aufwand bei der Gasaufbereitung.

Wie aus der Tabelle zu erkennen ist, kann Biogas nach entsprechender Aufbereitung wie Erdgas eingesetzt werden.

Durch entsprechende Maßnahmen der Politik, besonders durch die Einführung des Erneuerbare-Energien-Gesetzes ist die am weitesten verbreitete Anwendung von Biogas die Kraft-Wärme-Kopplung. Hierbei wird Biogas zum Betrieb eines Verbrennungsmotors verwendet, welcher einen Generator zur Erzeugung von Netzstrom antreibt. Die Motorabwärme aus Kühlung und Abgas kann für Heizzwecke verwendet werden. Bei den Motoren handelt es sich oft um Aggregate aus größeren Serienproduktionen, die auf die besonderen technischen Belange der Biogasnutzung angepasst werden. Unterschieden werden Motoren welche nach dem Gas-Otto-Prinzip rein mit Biogas arbeiten und Motoren die unter der Zugabe eines bestimmten Zündölanteils (Heizöl oder Pflanzenöl) auf einem Dieselprozess basieren. Reine Heizkessel für Biogas haben durch die wirtschaftlichere Kraft-Wärme-Kopplung an Bedeutung verloren.

Kochen mit Biogas ist eine sehr einfache, preiswerte und wirtschaftliche Lösung durch die Strom, Erdgas oder Holz gespart werden kann. In Schwellen- und Entwicklungsländern wird das in sehr einfachen Biogasanlagen erzeugte Gas überwiegend zum Kochen genutzt.

Bei der Nutzung von Biogas als Treibstoff gibt es technisch kaum Probleme wie Versuche mit Traktoren in der Landwirtschaft und Kompaktoren auf Mülldeponien gezeigt haben. Weltweit werden ungefähr eine Million Fahrzeuge mit Biogas betrieben. Die Reichweite von Biogasmobilen liegt zwischen 200 und 400 km.

In Deutschland laufen zurzeit erste Anlagen, bei denen Biogas auch in das öffentliche Erdgasnetz einzuspeisen.